海水淡化系统产水后需要进行脱硼处理，不同海水淡化方法产水的硼含量有所不同。

蒸馏法海水淡化产水中各种离子浓度都很低，硼也不例外，其含量在0.02mg/L以下。

反渗透法海水淡化（SWRO）产水硼含量较高，一般在0.7～1.8mg/L之间，这主要是因为反渗透膜在较低pH值时对硼的脱除率较低。

脱硼方法：

目前脱硼效果较好的方法主要有：反渗透（二级）、硼选择性离子交换树脂、强碱性阴离子交换树脂。

这三种方法都可以将硼降低到0.3mg/L以下，目前国际上大型反渗透海水淡化工程应用中，最常见的脱硼方法是采用部分或全部二级反渗透工艺。反渗透一级产水硼含量很难达到0.5mg/L以下，采用部分二级工艺，调节二级给水pH>10，产水硼含量可达标。

影响反渗透海水淡化产水硼含量的因素主要有两方面：一是给水水质因素，二是反渗透工艺因素。各因素与反渗透海水淡化产水硼含量的关系详见下图：